Как выделить главное из опухоли: новая технология точного анализа

В онкологической диагностике часто требуется провести молекулярное исследование конкретного участка опухоли, чтобы выявить драйверные мутации или оценить экспрессию генов. Однако опухоль гетерогенна, и анализ всего среза целиком может привести к потере важных сигналов из-за «разбавления» материала нормальными клетками. Решение этой проблемы — выделение наиболее показательного участка (области интереса) для последующего анализа. Для этого существуют методы микродиссекции.

Традиционные способы имеют серьёзные недостатки. Ручная микродиссекция даёт низкую точность (> 1 мм) и сильно зависит от квалификации оператора. Лазерная микродиссекция, напротив, очень точна (до 7,5 мкм), но требует часов кропотливого труда, специального оборудования и обученного персонала, что делает её малопригодной для повседневной рутинной работы в больнице.

В обзорной статье, опубликованной Golias и соавт. в 2025 году в журнале Pathology - Research and Practice, авторы всесторонне анализируют эволюцию методов микродиссекции и их место в современной диагностике. Они приходят к выводу, что для клинической практики наиболее перспективны методы мезодиссекции, которые обеспечивают баланс между точностью, скоростью и стоимостью. В качестве одного из ключевых примеров такой технологии авторы приводят платформу MiniPunch, разработанную компанией Excilone.

Принцип работы MiniPunch решает основные проблемы традиционных методов. Вместо долгой работы под микроскопом, специалист отмечает нужную область на цифровом изображении гистологического среза. Система автоматически переносит эту разметку на исходный парафиновый блок, где хранится образец. Далее автоматический манипулятор позиционирует одноразовую иглу, и тончайшая игла с внутренним диаметром 200 мкм вырезает миниатюрный столбик ткани (керн) строго из отмеченной зоны на заданную глубину. Вся процедура занимает около минуты.

Полученный микрокерн помещается в пробирку и готов к молекулярному анализу. При этом конструкция прибора и использование одноразовых игл полностью исключают перекрестное загрязнение между разными образцами. Важно, что технология бережно относится к архивным тканям: взятие микрокерна является минимально инвазивным и сохраняет донорский блок для будущих исследований.

Обзор Golias и соавт. подчеркивает, что MiniPunch — это не замена лазерной микродиссекции для фундаментальных научных задач, а практический инструмент для рутинной диагностики. Он позволяет лабораториям получать чистые опухолевые образцы для ПЦР и секвенирования с минимальными временными затратами и без необходимости в узкоспециализированных навыках лазерной диссекции.

Список литературы

1. Comparing RNA extraction protocols from formalin-fixed paraffin-embedded microcore samples. Maxime Golias (1,2,3), Zuzana Krupova (1), Pierre Defrenaix (1), Marie-Françoise Heymann (2,3*), Dominique Heymann (2,3,4¤*), December 8, 2025

1 — Excilone, Elancourt, France, 2 — Nantes Université, CNRS, UMR6286, US2B, Nantes, France, 3 — Institut de Cancérologie de l’Ouest, Tumor Heterogeneity and Precision Medicine Laboratory, Saint-Herblain, France, 4 — Université of Sheffield, School of Medicine and Population Health, Sheffield, United Kingdom ¤ Current address: Institut de Cancérologie de l’Ouest, Tumor Heterogeneity and Precision Medicine Laboratory, Blvd Jacques Monod, Saint-Herblain, 44805, France * dominique.heymann@univ-nantes.fr (DH); marie-francoise.heymann@ico.unicancer.fr (M-FH)