Микродиссекция для рутинной молекулярной диагностики: метод взятия кернов

Точный молекулярный анализ в онкологии требует выделения не всей ткани, а конкретной области интереса, например, инвазивного края опухоли или участка с максимальной клеточностью. Однако классические методы, такие как лазерная и ручная микродиссекция, либо слишком трудоемки для повседневной практики, либо обладают недостаточной точностью.

В обзорной статье Golias и соавт. (2025), опубликованной в журнале Pathology - Research and Practice, рассматриваются современные подходы к микродиссекции в эпоху персонализированной медицины. Авторы анализируют различные технологии, включая лазерную захватную микродиссекцию, микродиссекцию с катапультированием под давлением и методы мезодиссекции. Особое внимание в статье уделяется новым платформам, разработанным для рутинного использования в патологоанатомических лабораториях.

Среди таких технологий авторы выделяют платформу MiniPunch (Excilone), которая относится к категории мезодиссекции. Этот метод позволяет оператору получать тканевые столбики, или керны, непосредственно из формалин-фиксированных парафиновых (FFPE) блоков без использования предметных стекол. Рабочий процесс организован следующим образом: специалист отмечает область интереса на цифровом скане тканевого среза, после чего система MiniPunch автоматически переносит разметку на соответствующий парафиновый блок. Затем одноразовая игла с внутренним диаметром 200 мкм на заданную глубину от 200 до 700 мкм вырезает керн из строго определенной зоны, и образец помещается в пробирку для последующего анализа (ПЦР, секвенирование).

Ключевыми характеристиками метода, описанными в обзоре, являются точность 200 мкм, высокая скорость (около одной минуты на образец), исключение перекрестного загрязнения благодаря использованию одноразовых игл и полная автоматизация процесса. Согласно данным обзора, платформа MiniPunch успешно применяется для выделения опухолевых очагов при гетерогенных новообразованиях, анализа экспрессии микроРНК при колоректальном раке, а также для обогащения образцов при генетических и эпигенетических исследованиях.

Таким образом, метод взятия кернов, реализованный в платформе MiniPunch, занимает промежуточное положение между низкоточными ручными методиками и высокоточными, но медленными лазерными системами. Он ориентирован на рутинное применение в патологоанатомических лабораториях, где требуется сочетание приемлемой точности, высокой пропускной способности и полной автоматизации процесса.

Список литературы

1. Comparing RNA extraction protocols from formalin-fixed paraffin-embedded microcore samples. Maxime Golias (1,2,3), Zuzana Krupova (1), Pierre Defrenaix (1), Marie-Françoise Heymann (2,3*), Dominique Heymann (2,3,4¤*). December 8, 2025

1 — Excilone, Elancourt, France, 2 — Nantes Université, CNRS, UMR6286, US2B, Nantes, France, 3 — Institut de Cancérologie de l’Ouest, Tumor Heterogeneity and Precision Medicine Laboratory, Saint-Herblain, France, 4 — Université of Sheffield, School of Medicine and Population Health, Sheffield, United Kingdom ¤ Current address: Institut de Cancérologie de l’Ouest, Tumor Heterogeneity and Precision Medicine Laboratory, Blvd Jacques Monod, Saint-Herblain, 44805, France * dominique.heymann@univ-nantes.fr (DH); marie-francoise.heymann@ico.unicancer.fr (M-FH)